Айжан Есмағамбетова 1972 жылы Алматы облысында дүниеге келген. 1997 жылы Алматы мемлекеттік медицина университетін гигиенист дәрігер, эпидемиолог мамандығы бойынша тәмамдаған.
Еңбек жолын 1990 жылы Алматыдағы №7 емханада фельдшер-зертханашы болып бастаған.
1997-2004 жылдары Республикалық санитарлық-эпидемиологиялық станцияның аса қауіпті инфекциялар бөлімінде дәрігер-эпидемиолог, дәрігер-бактериолог, зертхана меңгерушісі болып жұмыс істеген.
2004-2014 жылдары ҚР ДСМ Мемлекеттік санитарлық-эпидемиологиялық қадағалау комитетінің құрылымында жетекші маманнан бастап төрағаға дейін түрлі лауазымды атқарған.
2014 жылы ҚР Тұтынушылардың құқықтарын қорғау агенттігінің эпидемиологиялық қадағалау департаментінің директоры — бас мемлекеттік санитар дәрігердің орынбасары,
2014-2017 жылдары ҚР ҰЭМ Тұтынушылардың құқықтарын қорғау комитетінің эпидемиологиялық қадағалау басқармасының басшысы,
2017 жылы ҚР ДСМ стратегиялық даму және қоғамдық денсаулық сақтау департаментінің директоры,
2017-2020 жылдары ҚР қоғамдық денсаулық сақтау саясаты департаментінің директоры қызметтерін атқарды.